Université de Reims Champagne-Ardenne > Recherche > Plateformes technologiques > Plate-forme de Modélisation Moléculaire Multi-échelle
Docking Docking inverse Champagne Acides Nucléiques Peptides et Membranes

 

P3M

Groupe de modélisation de l'unité MEDyC


Personnels impliqués :


DAUCHEZ Manuel, Professeur
BAUD Stephanie, MC
BELLOY Nicolas, IR
HASCHKA Thomas, Doctorant
VASSEUR Romain, Doctorant
GHIRARDI Maxime, etudiant M2R


Thématiques de recherche :


Les études de modélisation réalisées au sein de notre groupe suivent  principalement xx objectifs :

  • Essayer d'expliquer et élucider les processus d'agrégations réversibles et irréversibles qui sont observées lors de manipulations de montée en température mettant en œuvre les peptides d'élastine de séquences consensus (XGGZG)n, n variant de 1 à 3 et où les résidus X et Z sont les résidus Leucine et/ou Valine.
  • Tenter d'expliquer et d'élucider les processus d'interaction de l'EBP avec divers partenaires biologiques.

 

Méthodologies :


Dynamique moleculaire classique GROMACS, NAMD
Dynamique moleculaire gros grain OPEP
Amarrage moleculaire Autodock, Rosetta, Hex
Utilisation des nodes normaux et analyse en composantes principales des trajectories

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