Université de Reims Champagne-Ardenne > Recherche > Plateformes technologiques > Plate-forme de Modélisation Moléculaire Multi-échelle
Docking Docking inverse Champagne Acides Nucléiques Peptides et Membranes

 

P3M

Membres CReSTIC

Equipe SysCom laboratoire

Luiz Angelo STEFFENEL

  1. Thématiques de recherche:
    • Grilles de Calcul : communication dans des environnements hétérogènes, redistribution de données, modélisation de performance, ordonnancement, algorithmique
    • P2P et Grilles Pervasives : middleware pour le calcul distribué P2P (CONFIIT), coordination dans un environnement volatile, applications pair-à-pair
    • Tolérance aux Fautes : problèmes de coordination (consensus, élection, etc.), détection de défaillances, protocoles optimistes

     

  2. Méthodologie: modèle-implémentation-comparaison
  3.  

  4. Collaboration : avec Manuel Dauchez dans le cadre d'une thèse CIFRE (R. Vasseur)
  5.  


    Jean-Charles BOISSON

    1. Thématiques de recherche :
      • Métaheuristiques parallèles collaboratives : Design, analyse de paysage, développement de librairie, collaborateur CONFIIT.
      • Applications en bioinformatique
      •             → Identification de protéines : exploitation de spectres de masse, de novo proteinsequencing

                    → Docking moléculaire classique : multi-objectivisation du problème, benchmarking

                    → Docking moléculaire quantique :  déploiement sur architecture parallèle

      • Application en mathématique :  Identification de fissures dans les matériaux

       

    2. Méthodologie(indépendamment du problème):
      • modélisation des problèmes sous forme de problème d'optimisation combinatoire (représentation et fonction d'évaluation)
      • analyse de paysage
      • choix des méthodes d'optimisation
      •  au besoin : collaboration de méthodes + parallélisation

       

    3. Collaborations:

    Avec  Eric Hénon et Chantal Barberot (ICMR) sur une thématique de docking quantique. Intervention dans la partie design d'un algorithme génétique mono-objectif parallèle pour le problème du docking moléculaire quantique. Amélioration de l'ergonomie d'utilisation, de l'approche pour l'expert chimiste (configuration, déploiement et analyse de résultats).


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